Terveystieteelliset mittaukset, case-esimerkki

Mistä lähden liikkeelle?

  • Sovi tutkimusryhmän kesken systemaattisesta nimeämiskäytännöstä masterfile-kansioille, yksittäisille tiedostoille sekä eri versioille.

  • Luo hakemistojuureen ja kaikkiin keskeisiin alakansioihin README.txt-tiedosto, joka sisältää kuvauksen ko. hakemiston tiedostojen nimeämiskäytännöistä sekä tiiviin selityksen kunkin kansion ja tiedoston sisällöstä. 

  • Luo kunkin master-kansion yhteyteen METHODS_kansionnimi.txt-niminen tiedosto, joka sisältää linkin ko. aineistokokonaisuuden keruussa, käsittelyssä ja dokumentoinnissa käytettyjen menetelmien kuvaukseen. 

  • Luo kunkin master-kansion yhteyteen ABOUT_kansionnimi.txt-niminen kansio, joka sisältää linkin JYUn Converikseen laadittuun metadatatietueeseen. Converis-metadatatietue sisältää aineiston peruskuvailutiedot, erit. 

    nimi
    tekijät
    abstrakti, ml. tiedostoformaattien kuvaus
    oikeudenhaltijat
    liittyvä hanke
    liittyvät julkaisut
    asiasanat
    jakelija
    viimeisin muokkauspäivämäärä
    lisenssitiedot/saatavuuden mahdolliset rajoittamistiedot
    suunniteltu elinkaari
    julkaistavan aineiston suunniteltu data-arkisto

    Converis-kuvailun ohjeet löydät täältä.

  • Sisällytä metodikuvailuun kuvaus standards of proceduresta (SOP), mittauslaitteista sekä analyysiskripteistä. Esimerkki: avaintietoja puettavista antureista saatavasta datasta ovat:
    anturin nimi
    mittauslokaatio
    anturin kiinnitystapa
    tallennuksen kesto
    resoluutio. 

Miten etenen analyysin aikana?

  • Tallenna ja kuvaile datan tilastolliseen prosessointiin käytetty syntaksi. Ks. Tietoarkiston SPSS-syntaksiohje

  • Ks. esimerkki taulukkomuotoisesta mittauskuvailusta. 

  • Sähköiset laboratoriopäiväkirjat (ELN) ovat yleistyviä päivittäisen dokumentaation työkaluja. Voit vertailla markkinoilla olevia tuotteita esim. Harvard Medical Schoolin ylläpitämästä taulukosta

Tutustu myös terveys- ja luonnontieteiden avoimen dokumentaatio-oppaan RDMKitin dokumentaatio-ohjeisiin